宝马合格证编号可以在4S店提取时或车管所查看。

在4S店提取：

当车主提车时，可以向4S店的工作人员索取随车出厂的车辆合格证，证书上会显示车辆合格证编号。然而，由于车辆合格证需要在上牌登记时上交给车管所保留，车主只能在上牌后换回机动车登记证书，而没有车辆合格证。

在车管所查看：

如果车主想要查看车辆合格证编号，可以咨询汽车经销商是否可以在车辆登记的车管所根据发动机号查询车辆合格证编号。同时，根据发动机号还可以对比车辆出厂时的随车记录和行驶证的发动机号是否一致。