对于新车的无牌车辆，合格证应该在经销商手中，而有牌车辆的合格证则存档在车管所。

车辆出厂时会附带车辆合格证，但车主在提车时可以向4S店工作人员索要随车交付的车辆合格证，上面会有车辆合格证的编号。然而，在办理新车注册登记时，车主需要将车辆合格证交给车管所保存，因此车主在交完车辆合格证后，如果想查询车辆合格证号，可以咨询车商，在车辆注册地的车管所根据发动机号查到车辆合格证号。此外，通过比对发动机号，还可以了解汽车出厂时的随车记录和行驶证的发动机号是否一致。